La base de datos de muestras de suelo facilitará las investigaciones

La omnipresencia del suelo y la capacidad de moverlo fácilmente en zapatos, ropa, herramientas o vehículos lo convierte en un material de evidencia particularmente valioso que le permite adjuntar un sospechoso u objeto a una ubicación específica. Sin embargo, a menudo sucede que la información obtenida gracias a los análisis basados ​​en las propiedades físicas y químicas de los suelos que se utilizan actualmente en medicina forense no es suficiente para verificar las hipótesis probadas en el curso de las investigaciones.

Por ello, los científicos del consorcio interfacultativo del proyecto MIKROBIOM están desarrollando una nueva herramienta para comparar muestras de suelo que también permitirá vincularlas a un sitio específico. “Al proporcionar evidencia que confirme la presencia de sospechosos en lugares específicos o identificar rutas de transporte criminales, el sistema desarrollado puede guiar la investigación y, por lo tanto, acelerar el proceso de investigación”, afirma el comunicado de prensa del Centro de Biotecnología de Malopolska en la Universidad Jagiellonian ( MCB) UJ.

Los científicos analizaron 960 muestras de suelo recolectadas en diferentes lugares de Polonia. Por lo tanto, obtuvieron datos de la secuenciación profunda de ADN de microbios de muestras de suelo. Por lo tanto, se ha desarrollado un conjunto de marcadores metagenómicos para identificar eficientemente las muestras de suelo.

«Los conjuntos de secuencias obtenidos para cada muestra de suelo se colocan en la base de datos que constituye el primer mapa de ADN del microbioma ecológico polaco. El sistema resultante estará equipado con herramientas para la búsqueda eficiente de los recursos de la base de datos y la interpretación de los resultados del análisis. Como resultado, el resultado de la prueba genética obtenida se comparará en él para una muestra de suelo de origen desconocido, en forma de perfil de ADN del microbioma, con la base de datos, y la muestra analizada se asignará a la ubicación más probable en el mapa de Polonia” – informó MCB UJ, citado en el comunicado de prensa.

«El proyecto ha producido datos metagenómicos del suelo con una profundidad sin precedentes de más de 100 millones de lecturas por muestra, lo que permitirá nuevos descubrimientos en el microbioma y los estudios del suelo. Este enfoque no se ha utilizado en el mundo hasta la fecha», dice el comunicado de prensa. leer. .

A nivel mundial existen reportes individuales que solo señalan la posibilidad de utilizar la predicción de composición de microorganismos por geolocalización en medicina forense.

El conocimiento y el sistema únicos que consisten en una base de datos, un algoritmo para usar sus recursos y pruebas genéticas en la tecnología de análisis metagenómico NGS desarrollada en el proyecto pueden usarse para predecir el origen de muestras desconocidas no solo en casos criminales, argumentaron los científicos.

El proyecto está siendo implementado por un consorcio formado por: Laboratorio Forense de la Policía Central en Varsovia (comandante), MCB UJ, Universidad Médica de Pomerania, Universidad Médica de Varsovia y Ardigen.

El proyecto principal opera, es decir, crea y prueba una base de datos que contiene la composición taxonómica del microbioma, realiza bioinformática y análisis estadístico de datos WGS (Whole Genome Sequencing) que conducen a la selección de marcadores para la identificación de microorganismos, el desarrollo de genes y la validación. La prueba es coordinada por el profesor. Wojciech Branicki y Doctor Love. METRO. Pawe abaj de MCB UJ.

La investigación está financiada por el Centro Nacional de Investigación y Desarrollo.

PAP – Ciencia en Polonia

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